Bandage-NG：基因组组装图可视化工具

项目简介

Bandage-NG 是一个带图形界面的桌面程序，用于与 de novo 组装器（如 SPAdes、MEGAHIT 等）生成的组装图进行交互。

de novo 组装图里除了已组装的 contig，还包含 contig 之间的连接关系，这些信息过去不容易查看。Bandage 通过图布局算法把组装图和连接一起画出来，让用户可以直观地分析、改进组装结果。

注意：本仓库是原 Bandage 仓库的 fork，可能包含新功能和新 bug，也可能与 Ryan Wick 的 Bandage 不兼容；文档和说明同样可能不完整或有误。

主要功能

• 可视化 de novo 组装图，显示 contig 之间的连接关系
• 使用 OGDF 库进行图布局
• 图中的节点代表 contig，可自动标注其 ID、长度或 depth
• 支持移动节点、修改标签、为节点着色
• 可直接从图视图中提取序列信息
• 程序内置帮助提示：界面控件旁带有问号图标，点击即可查看该元素的说明

安装与使用

预编译的 Linux 和 macOS 二进制文件可在 Releases 页面获取。

从源码构建需要 Qt 6、CMake 和支持 C++17 的编译器：

mkdir build
cd build
cmake ..
make

使用文档位于 Bandage-NG GitHub wiki。

注意事项

• 本项目是 Bandage 的 fork，功能和行为可能与原版存在差异，兼容性不作保证。
• 文档、使用说明可能缺失或不准确，遇到问题可在仓库的 Issues 区反馈。
• 许可证为 GNU General Public License, version 3（GPL-3.0）。

本作品整理自 GitHub 开源项目 asl/BandageNG，原作者 @asl，许可证 GPL-3.0。中文介绍由 AI 根据项目 README 整理，以原仓库为准。